涅吉在魔法学园毕业，作为见习魔法使的修行而来到日本的麻帆良学园担任女子初中部2年A组的班主任，经历了第一季和第二季各种混乱事件后，涅吉和学生们迎来了最后一年的初中生活。新作的事件背景设置在漫画版中升上初三后、结束了修学旅行和学园祭之后，主要讲述的是学生们的暑假生活。这次等待着涅吉及31名少女的又是什么奇怪事件呢？
